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Nature綜述| 最全!臨床受益的免疫檢查點(diǎn),碼住收藏

2024-08-26    點(diǎn)擊量:611


自十多年前靶向CTLA4的伊匹木單抗(Ipilimumab)首次用于轉(zhuǎn)移性黑色素瘤以來,免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICIs)的研究和應(yīng)用可謂如火如荼,如今,至少有8種ICI和35種基于ICI的聯(lián)合免疫療法獲得FDA批準(zhǔn)。對于選擇ICI治療的患者來說,準(zhǔn)確的生物標(biāo)志物既能最大化治療效果,又能減少不良反應(yīng)。本篇文章來自 nature reviews cancer,全面總結(jié)了用于預(yù)測ICI反應(yīng)或耐藥的各類生物標(biāo)志物(圖1),以及當(dāng)前的挑戰(zhàn)和進(jìn)展。

圖1 實(shí)體腫瘤免疫檢查點(diǎn)抑制劑的預(yù)測性生物標(biāo)志物



  01  

 靜態(tài)生物標(biāo)志物

程序性細(xì)胞死亡蛋白(PD1)通過與其兩個(gè)配體——PDL1和PDL2的相互作用負(fù)向調(diào)節(jié)T細(xì)胞的免疫活性。PD1和PDL1的單克隆抗體已被FDA批準(zhǔn)用于各種癌癥類型(圖2)。通過對腫瘤組織進(jìn)行PDL1的免疫組化(IHC),進(jìn)行TPS評分,即在任何強(qiáng)度下顯示部分或完全膜染色的活腫瘤細(xì)胞的百分比,最初被FDA批準(zhǔn)作為晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的伴隨診斷測試。

圖2 NSCLC的免疫治療

但是,由于各種原因,PDL1作為預(yù)測ICIs反應(yīng)的生物標(biāo)志物的廣泛應(yīng)用受到限制。首先,最有可能從治療中受益的隊(duì)列臨界值因癌癥類型而異。其次,評估PDL1表達(dá)的細(xì)胞群也因癌癥類型而異,其中包括腫瘤細(xì)胞、免疫細(xì)胞或兩者組合。再次,許多癌癥類型在PDL1表達(dá)與免疫治療應(yīng)答之間幾乎沒有相關(guān)性。最后,在同一患者中,PDL1在不同腫瘤病變中,甚至在同一腫瘤中表達(dá)不一致。

免疫治療是否有反應(yīng)主要看T細(xì)胞能否識別新抗原。目前,從腫瘤組織和循環(huán)腫瘤DNA (ctDNA)中獲得樣本,進(jìn)行下一代測序(NGS),可以測量腫瘤突變負(fù)荷(TMB。TMB強(qiáng)弱取決于多種因素,包括:腫瘤呈現(xiàn)的腫瘤新抗原;腫瘤新抗原被免疫系統(tǒng)識別;宿主產(chǎn)生抗原特異性反應(yīng)的能力等。

基于組織生物標(biāo)志物具有一下局限性:①分析方法的局限性;②生物標(biāo)志物的準(zhǔn)確性和一致性;③腫瘤的異質(zhì)性;④患者的異質(zhì)性。因此,需要尋找新的生物標(biāo)志物。


02  

 動(dòng)態(tài)生物標(biāo)志物

由于生物標(biāo)志物的表達(dá)可能會隨著時(shí)間的推移和治療進(jìn)程而改變,因此,對腫瘤和免疫生物學(xué)的靜態(tài)、單一評估是不夠真實(shí)的。幾項(xiàng)研究表明,當(dāng)治療前和治療后的樣本一起納入時(shí),與ICI治療相關(guān)的反應(yīng)/無反應(yīng)變化更易識別,這說明了動(dòng)態(tài)而非靜態(tài)生物標(biāo)志物的重要性。

1. 低侵入性動(dòng)態(tài)生物標(biāo)志物

動(dòng)態(tài)進(jìn)行組織取樣具有局限性,因此,基于血液的分析被認(rèn)為是一種更適合縱向評估的模式。其易于獲取,并發(fā)癥風(fēng)險(xiǎn)較低,侵入性小,患者的疼痛更少,可以廣泛應(yīng)用,更具有成本效益。這種方法還具有對個(gè)體內(nèi)所有腫瘤病變進(jìn)行生物學(xué)評估的優(yōu)勢(反映的是平均讀數(shù),而不是特定部位的讀數(shù)),因此可以很好地評估與治療相關(guān)的系統(tǒng)動(dòng)態(tài)變化。

2. 放射組學(xué)作為預(yù)測因子

通過使用非侵入性生物標(biāo)志物(如影像數(shù)據(jù)),也可以克服基于組織活檢的局限性。成像生物標(biāo)志物的優(yōu)點(diǎn)是能夠可視化任何時(shí)間點(diǎn)、任何轉(zhuǎn)移潛在部位的腫瘤,因此它們可以在未來作為非侵入性動(dòng)態(tài)生物標(biāo)志物發(fā)揮作用。

3. 腸道微生物組生物標(biāo)志物

大量研究表明,特定的腸道微生物組與各種癌癥類型的ICI反應(yīng)顯著相關(guān)。四項(xiàng)宏基因組研究的薈萃分析證明某些細(xì)菌分類群、代謝組學(xué)途徑的富集與黑色素瘤患者的ICI反應(yīng)顯著相關(guān)(圖3)。此外,新的機(jī)器學(xué)習(xí)模型已經(jīng)能夠?qū)⑻囟?xì)菌屬與免疫治療反應(yīng)聯(lián)系起來。其他研究甚至揭示了單個(gè)細(xì)菌類群能正向或負(fù)向調(diào)節(jié)宿主免疫系統(tǒng),從而在癌細(xì)胞免疫逃逸方面發(fā)揮作用。

圖3 黑色素瘤示意圖


03  

患者特異性的生物標(biāo)志物

隨著新輔助治療方法的發(fā)展,新的試驗(yàn)如PRADO試驗(yàn),納入了患者特異性病理反應(yīng)數(shù)據(jù),來確定下一步的臨床干預(yù)措施。
離體腫瘤模型也具有預(yù)測患者特異性反應(yīng)的潛力。與用于血液系統(tǒng)惡性腫瘤藥物反應(yīng)分析的體外平臺相反,實(shí)體腫瘤由于其特定的腫瘤微結(jié)構(gòu)和腫瘤-免疫相互作用,不能通過簡單的腫瘤細(xì)胞培養(yǎng)輕易復(fù)制。而患者來源的腫瘤球體、類器官或芯片上的器官可以克服此難點(diǎn),因?yàn)樗鼈儾粌H可以通過自體腫瘤細(xì)胞,還可以通過結(jié)合淋巴細(xì)胞和髓細(xì)胞免疫群體來以驗(yàn)證ICI反應(yīng),具有患者特異性,能夠重建更精確的3D環(huán)境。


04  

當(dāng)前進(jìn)展

目前,多機(jī)構(gòu)、多國別合作整合不同時(shí)間點(diǎn)的多個(gè)來源的數(shù)據(jù),通過機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建框架,為識別和驗(yàn)證更精細(xì)的生物標(biāo)志物奠定基礎(chǔ)。迄今為止已發(fā)表的(表1)和進(jìn)行中的研究(表2)如下表:
表1 免疫檢查點(diǎn)抑制劑反應(yīng)的預(yù)測性生物標(biāo)志物已發(fā)表研究


表2 免疫檢查點(diǎn)抑制劑反應(yīng)的預(yù)測性生物標(biāo)志物的在研試驗(yàn)

 

 

 05  

 結(jié)語


目前有各種各樣的腫瘤生物標(biāo)志物正在試驗(yàn)中,隨著我們向精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)時(shí)代的過渡,個(gè)體患者水平的預(yù)測分析終將實(shí)現(xiàn)。理想的生物標(biāo)志物預(yù)測模型將通過整合腫瘤、免疫微環(huán)境和宿主因素,提供腫瘤反應(yīng)或進(jìn)展的動(dòng)態(tài)評估信息。


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